Različica SARS-CoV-2 gama

Iz Wikipedije, proste enciklopedije
Jump to navigation Jump to search
Skupno število potrjenih vzorcev P.1 po državah na dan 21. 4. 2021[1]
Legenda:
  ≥ 1.000 potrjenih vzorcev
  500–999 potrjenih vzorcev
  100–499 potrjenih vzorcev
  2–99 potrjenih vzorcev
  1 potrjen vzorec sequence
  ni potrjenih vzorcev ali ni podatka

Različica gama virusa SARS-CoV-2, imenovana tudi varianta gama, linija P.1, VOC-202101/02[2] ali neustrezno brazilska različica[3][4][5] je ena od virusnih različic SARS-CoV-2, povzročitelja covida 19.[6] Ima 17 aminokislinskih substitucij (mutacij v zaporedju aminokislin), od česar jih je deset v konični beljakovini in nadalje tri od njih posebej zaskrbljujoče: N501Y, E484K in K417T.[7][8] Prvič so jo zaznali v Nacionalnem inštitutu za nalezljive bolezni na Japonskem, in sicer pri štirih osebah, ki so šriti dni pred tem pripotovale iz brazilske zvezne države Amazonas.[7][9] Kasneje so potrdili, da gre za različico, ki kroži med prebivalstvom Brazilije.[7]

V začetku leta 2021 je različica gama povzročila obširen izbruh v Manausu, prestolnici države Amazonas, ki je sicer doživelo hud izbruh covida 19 že v maju 2020[10] in za katerega prebivalstvo je raziskava[11] pokazala veliko prekuženost oziroma seroprevalenco protiteles proti SARS-CoV-2.[12] Raziskava, objavljena v strokovni reviji Science Journal je pokazala za različico gama, da se lažje prenaša in ima višjo smrtnos (v primerjavi z B.1.1.28).[13]

Obstajata dve podrazličici, in sicer 28-AM-1 in 28-AM-2; pri obeh so prisotne mutacije K417T, E484K in N501Y, razvili pa sta se nepovezano ena od druge v amazonskem predelu Brazilije.[14]

V Sloveniji se različica beta ni razširila; do 17. junija 2021 so na primer v Nacionalnem laboratoriju za zdravje, okolje in hrano med vsemi testiranimi vzorci skupno potrdili različico gama le pri sedmih vzorcih,[15] na Inštitutu za mikrobiologijo pa do 1. 8. 2021 pri treh vzorcih.[16]

Sklici[uredi | uredi kodo]

  1. "Lineage P.1". cov-lineages.org. Pridobljeno dne 2021-04-21.
  2. Public Health England (27. 2. 2021). "Variants: distribution of cases data". GOV.UK (angleščina). Pridobljeno dne 27. 2. 2021.
  3. Feil, Ed (2. 6. 2021). "Grške črke za različice koronavirusa". Delo. Pridobljeno dne 17. 8. 2021.
  4. "Covid-19: Brazil virus already in UK 'not variant of concern', scientist says". www.bbc.com. 15. 1. 2021. Pridobljeno dne 15. 1. 2021.
  5. "COVID-19: Virologist says Brazilian coronavirus variant detected in UK is not the one 'of concern'". news.sky.com. 15. 1. 2021. Pridobljeno dne 15. 1. 2021.
  6. Newey, Sarah (12. 1. 2021). "Third concerning coronavirus variant should be a 'wake up call' to the world, experts warn". The Telegraph. Pridobljeno dne 17. 1. 2021.
  7. 7,0 7,1 7,2 Faria, Nuno R.; Claro, Ingra Morales (12. 1. 2021). "Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings". Virological (angleščina). Pridobljeno dne 2021-01-23.
  8. "COG-UK Report on SARS-CoV-2 Spike mutations of interest in the UK" (PDF). Covid-19 Genomics UK Consortium. 15. 1. 2021. Pridobljeno dne 25. 1. 2021.
  9. "Japan finds new coronavirus variant in travelers from Brazil". Japan Today. Japan. 11. 1. 2021. Pridobljeno dne 14. 1. 2021.
  10. Matt Rivers (28. 1. 2021). "Is a new coronavirus variant to blame for this Brazilian city's collapse?". CNN.
  11. Buss, Lewis F.; Prete, Carlos A.; Abrahim, Claudia M. M.; Mendrone, Alfredo; Salomon, Tassila; de Almeida-Neto, Cesar; et al. (8. 12. 2020). "Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic". Science. American Association for the Advancement of Science. 371 (6526): 288–292. doi:10.1126/science.abe9728. ISSN 0036-8075. PMC 7857406. PMID 33293339 Preveri |pmid= vrednost (pomoč).
  12. Sabino, Ester C.; Buss, Lewis F.; Carvalho, Maria P. S.; Prete, Carlos A.; Crispim, Myuki A. E.; Fraiji, Nelson A.; et al. (27. 1. 2021). "Resurgence of COVID-19 in Manaus, Brazil, despite high seroprevalence". The Lancet (angleščina). 397 (10273): 452–455. doi:10.1016/S0140-6736(21)00183-5. ISSN 0140-6736. PMC 7906746. PMID 33515491 Preveri |pmid= vrednost (pomoč).
  13. "Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil". Science Magazine. 31. 5. 2021. Pridobljeno dne 7. 7. 2021.
  14. Toovey, Oliver T.R.; Harvey, Kirsty N.; Bird, Paul W.; Wei-Tze Wei-Tze Tang, Julian (3. 2. 2021). "Introduction of Brazilian SARS-CoV-2 484K.V2 related variants into the UK". Journal of Infection. 82 (5): e23–e24. doi:10.1016/j.jinf.2021.01.025. PMC 7857057. PMID 33548358 Preveri |pmid= vrednost (pomoč).
  15. "Sledenje različicam SARS-CoV-2". Nacionalni laboratorij za zdravje, okolje in hrano. 17. 6. 2021. Pridobljeno dne 9. 9. 2021.
  16. "Sistematično genomsko opredeljevanje in spremljanje epidemije SARS-CoV-2 v Sloveniji na Inštitutu za mikrobiologijo in imunologijo Medicinske fakultete Univerze v Ljubljani, Rezultati testiranja 272 vzorcev odvzetih med 26. 07. 2021 in 01. 08. 2021". Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo. 12. 8. 2021. Pridobljeno dne 9. 9. 2021.