Različica SARS-CoV-2 gama

Iz Wikipedije, proste enciklopedije
Jump to navigation Jump to search
Skupno število potrjenih vzorcev P.1 po državah na dan 21. 4. 2021[1]
Legenda:
  ≥ 1.000 potrjenih vzorcev
  500–999 potrjenih vzorcev
  100–499 potrjenih vzorcev
  2–99 potrjenih vzorcev
  1 potrjen vzorec sequence
  ni potrjenih vzorcev ali ni podatka

Različica gama virusa SARS-CoV-2, imenovana tudi varianta gama, linija P.1, VOC-202101/02[2] ali neustrezno brazilska različica[3][4][5] je ena od virusnih različic SARS-CoV-2, povzročitelja covida 19.[6] Ima 17 aminokislinskih substitucij (mutacij v zaporedju aminokislin), od česar jih je deset v konični beljakovini in nadalje tri od njih posebej zaskrbljujoče: N501Y, E484K in K417T.[7][8] Prvič so jo zaznali v Nacionalnem inštitutu za nalezljive bolezni na Japonskem, in sicer pri štirih osebah, ki so šriti dni pred tem pripotovale iz brazilske zvezne države Amazonas.[7][9] Kasneje so potrdili, da gre za različico, ki kroži med prebivalstvom Brazilije.[7]

V začetku leta 2021 je različica gama povzročila obširen izbruh v Manausu, prestolnici države Amazonas, ki je sicer doživelo hud izbruh covida 19 že v maju 2020[10] in za katerega prebivalstvo je raziskava[11] pokazala veliko prekuženost oziroma seroprevalenco protiteles proti SARS-CoV-2.[12] Raziskava, objavljena v strokovni reviji Science Journal je pokazala za različico gama, da se lažje prenaša in ima višjo smrtnos (v primerjavi z B.1.1.28).[13]

Obstajata dve podrazličici, in sicer 28-AM-1 in 28-AM-2; pri obeh so prisotne mutacije K417T, E484K in N501Y, razvili pa sta se nepovezano ena od druge v amazonskem predelu Brazilije.[14]

V Sloveniji se različica beta ni razširila; do 17. junija 2021 so na primer v Nacionalnem laboratoriju za zdravje, okolje in hrano med vsemi testiranimi vzorci skupno potrdili različico gama le pri sedmih vzorcih,[15] na Inštitutu za mikrobiologijo pa do 1. 8. 2021 pri treh vzorcih.[16]

Sklici[uredi | uredi kodo]

  1. ↑ "Lineage P.1". cov-lineages.org. Pridobljeno dne 2021-04-21.
  2. ↑ Public Health England (27. 2. 2021). "Variants: distribution of cases data". GOV.UK (angleščina). Pridobljeno dne 27. 2. 2021.
  3. ↑ Feil, Ed (2. 6. 2021). "Grške črke za različice koronavirusa". Delo. Pridobljeno dne 17. 8. 2021.
  4. ↑ "Covid-19: Brazil virus already in UK 'not variant of concern', scientist says". www.bbc.com. 15. 1. 2021. Pridobljeno dne 15. 1. 2021.
  5. ↑ "COVID-19: Virologist says Brazilian coronavirus variant detected in UK is not the one 'of concern'". news.sky.com. 15. 1. 2021. Pridobljeno dne 15. 1. 2021.
  6. ↑ Newey, Sarah (12. 1. 2021). "Third concerning coronavirus variant should be a 'wake up call' to the world, experts warn". The Telegraph. Pridobljeno dne 17. 1. 2021.
  7. ↑ 7,0 7,1 7,2 Faria, Nuno R.; Claro, Ingra Morales (12. 1. 2021). "Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings". Virological (angleščina). Pridobljeno dne 2021-01-23.
  8. ↑ "COG-UK Report on SARS-CoV-2 Spike mutations of interest in the UK" (PDF). Covid-19 Genomics UK Consortium. 15. 1. 2021. Pridobljeno dne 25. 1. 2021.
  9. ↑ "Japan finds new coronavirus variant in travelers from Brazil". Japan Today. Japan. 11. 1. 2021. Pridobljeno dne 14. 1. 2021.
  10. ↑ Matt Rivers (28. 1. 2021). "Is a new coronavirus variant to blame for this Brazilian city's collapse?". CNN.
  11. ↑ Buss, Lewis F.; Prete, Carlos A.; Abrahim, Claudia M. M.; Mendrone, Alfredo; Salomon, Tassila; de Almeida-Neto, Cesar; et al. (8. 12. 2020). "Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic". Science. American Association for the Advancement of Science. 371 (6526): 288–292. doi:10.1126/science.abe9728. ISSN 0036-8075. PMC 7857406. PMID 33293339 Preveri |pmid= vrednost (pomoč).
  12. ↑ Sabino, Ester C.; Buss, Lewis F.; Carvalho, Maria P. S.; Prete, Carlos A.; Crispim, Myuki A. E.; Fraiji, Nelson A.; et al. (27. 1. 2021). "Resurgence of COVID-19 in Manaus, Brazil, despite high seroprevalence". The Lancet (angleščina). 397 (10273): 452–455. doi:10.1016/S0140-6736(21)00183-5. ISSN 0140-6736. PMC 7906746. PMID 33515491 Preveri |pmid= vrednost (pomoč).
  13. ↑ "Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil". Science Magazine. 31. 5. 2021. Pridobljeno dne 7. 7. 2021.
  14. ↑ Toovey, Oliver T.R.; Harvey, Kirsty N.; Bird, Paul W.; Wei-Tze Wei-Tze Tang, Julian (3. 2. 2021). "Introduction of Brazilian SARS-CoV-2 484K.V2 related variants into the UK". Journal of Infection. 82 (5): e23–e24. doi:10.1016/j.jinf.2021.01.025. PMC 7857057. PMID 33548358 Preveri |pmid= vrednost (pomoč).
  15. ↑ "Sledenje različicam SARS-CoV-2". Nacionalni laboratorij za zdravje, okolje in hrano. 17. 6. 2021. Pridobljeno dne 9. 9. 2021.
  16. ↑ "Sistematično genomsko opredeljevanje in spremljanje epidemije SARS-CoV-2 v Sloveniji na Inštitutu za mikrobiologijo in imunologijo Medicinske fakultete Univerze v Ljubljani, Rezultati testiranja 272 vzorcev odvzetih med 26. 07. 2021 in 01. 08. 2021". Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo. 12. 8. 2021. Pridobljeno dne 9. 9. 2021.
Vzpostavljeno iz »https://sl.wikipedia.org/w/index.php?title=Različica_SARS-CoV-2_gama&oldid=5605387«