ChEBI

Iz Wikipedije, proste enciklopedije
Jump to navigation Jump to search
ChEBI
Vsebina
Opis Kemijska podatkovna zbirka
Tipi zajetih
podatkov
Chemical Entities of Biological Interest
Kontakt
Raziskovalni center European Molecular Biology Laboratory
Laboratorij Zastava Združenega kraljestva European Bioinformatics Institute
Glavni citat [1]
Dostop
Spletna stran ChEBI
URL za prenos Downloads
Web service URL Web Service
Sparql dostopna točka BIO2RDF
Orodja
Web ChEBI Website
Razno
obnavljanje
podatkov
mesečno
stališče do kuratiranja Manually curated

Biološko pomembne kemijske entitete (iz angleškega Chemical Entities of Biological Interest)[2][3] je zbirka podatkov in ontologij molekularnih entitet, osredotočena predvsem na »majhne« kemijske spojine.

Izraz »molekularna entiteta« zajema »vse atome in njihove izotope, molekule, ione, ionske pare, radikale, radikalske ione, komplekse, konformacije itd., ki so prepoznavni kot samostojni subjekti«.[4] Molekularne entitete so bodisi naravni ali sintetični produkti, ki imajo potencialno biološko aktivnost. Gensko kodirane molekule, kot so nukleinske kisline, proteini in peptidi, ki nastajajo s proteolizo, se praviloma ne vnašajo v ChEBI.

Področje uporabe in dostopnost[uredi | uredi kodo]

Vsi podatki v zbirki so nezaščiteni ali pridobljeni iz nezaščitenih virov in zato dostopni vsakomur preko javnega spletnega vmesnika. Vsi podatki so popolnoma sledljivi in se izrecno sklicujejo na vir.

Slici[uredi | uredi kodo]

  1. de Matos P, Alcántara R, Dekker A, Ennis M, Hastings J, Haug K, Spiteri I, Turner S, Steinbeck C (January 2010). "Chemical Entities of Biological Interest: an update". Nucleic Acids Research 38 (Database issue): D249–54. PMC 2808869. PMID 19854951. doi:10.1093/nar/gkp886. 
  2. P. De Matos, R. Alcantara, A. Dekker, M. Ennis, J. Hastings, K. Haug, I. Spiteri, S. Turner, C. Steinbeck (2009). Chemical Entities of Biological Interest: An update. Nucleic Acids Research 38: D249–54. DOI: 10.1093/nar/gkp886.PMID 19854951.
  3. K. Degtyarenko, P. De Matos, M. Ennis, J. Hastings, M. Zbinden, A. McNaught, R. Alcantara, M. Darsow in drugi (2007). ChEBI: A database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Research 36: D344–50. doi:10.1093/nar/gkm791. PMC 2238832. PMID 17932057.
  4. molecular entity. IUPAC, Compendium of Chemical Terminology, 2. izdaja, 1997.

Zunanje povezave[uredi | uredi kodo]