Na nadmorski višini 3600 m je najvišje jezero na planoti Pamir, blizu stičišča gorovja Pamir, Tjanšan in Kunlun. Trije najvišji vrhovi, ki so obdani z gorami, ki ostanejo vse leto pokrite s snegom, so Muztagh Ata (7546 m), Kongur Tagh (7649 m) in Kongur Tiube (7530 m). Stopljena voda iz bližnjih ledenikov Muztagh Ata močno vpliva na kemijo jezerske vode in usedlin.[3][4]
Jezero je priljubljeno med popotniki zaradi svoje pokrajine in jasnosti svojega odseva v vodi, katere barva sega od temno zelene do azurne in svetlo modre. Ob obali jezera Karakul sta dve kirgiški naselji, majhno število jurt približno 1 km vzhodno od postajališča avtobusa in vas s kamnitimi hišami na zahodnih obalah.