Različica SARS-CoV-2 beta
Različica beta virusa SARS-CoV-2,[1][2] imenovana tudi varianta beta, linija B.1.351 ali neustrezno južnoafriška različica,[3] je ena od virusnih različic SARS-CoV-2, povzročitelja covida 19. Prvič so jo odkrili oktobra 2020 v južnoafriški provinci Eastern Cape.[4][5] Filogeografska analiza virusnega genoma nakazuje, da se je različica v tej južnoafriški provinci pojavila že julija ali avgusta 2020.[6]
Svetovna zdravstvena organizacija jo je opredelila kot zaskrbljujočo različico.[7] To so različice virusa SARS-CoV-2 z mutacijami v domeni za receptorsko vezavo (RBD, angl. Receptor Binding Domain), ki občutno povečajo vezavno afiniteto virusa na receptorje ter posledično povečajo prenašanje virusa.[8]
Mutacije
[uredi | uredi kodo]Različica alfa ima spremembe v konični beljakovini (proteinu S), in sicer so ugotovili devet mutacij v področju proteina S. Najpomembnejša je mutacija E484K, za katero so pri nekaterih bolnikih ugotovili, da manjša učinek nevtralizacijskih protiteles. Torej gre za tako imenovano ubežno mutacijo (angl. escape mutation), ki virusu omogoča, da se lažje izogne imunskemu odzivu.[9]
Poleg mutacije E484K vsebuje še dve pomembni mutaciji v področju proteina S, K417N in N501Y.[10] Nadaljnih pet mutacij v področju proteina S, L18F, D80A, D215G, R246I in A701V, zgleda ni tako zaskrbljujočih.[10]
Različica beta v Sloveniji
[uredi | uredi kodo]V Sloveniji so različico beta prvič odkrili konec februarja 2021, in sicer pri osebi v mariborski regiji, ki je pripotovala iz Afrike.[11] Različica ni doživela večjega razmaha med slovenskimi bolniki; do konca junija 2021 so jo na primer skupno dokazali pri 29 osebah.[12]
Sklici
[uredi | uredi kodo]- ↑ »GISAID - hCov19 Variants«. www.gisaid.org. Pridobljeno 21. julija 2021.
- ↑ »Tracking SARS-CoV-2 variants«. www.who.int (v angleščini). Pridobljeno 1. junija 2021.
- ↑ Feil, Ed (2. junij 2021). »Grške črke za različice koronavirusa«. Delo. Pridobljeno 17. avgusta 2021.
- ↑ »Covid: South Africa passes one million infections as cases surge«. BBC News (v britanski angleščini). 28. december 2020. Pridobljeno 29. decembra 2020.
- ↑ »South Africa announces a new coronavirus variant«. The New York Times. 18. december 2020. Pridobljeno 20. decembra 2020.
N501Y...has been found in other countries, including the United Kingdom
- ↑ Houriiyah Tegally; in sod. (22. december 2020). »Emergence and rapid spread of a new severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2 (SARS-CoV-2) lineage with multiple spike mutations in South Africa«. medrxiv. doi:10.1101/2020.12.21.20248640. Pridobljeno 10. marca 2021.
Spatiotemporal phylogeographic analysis suggests that the 501Y.V2 lineage emerged in early August (early July – end August 2020, 95% highest posterior density) in Nelson Mandela Bay.
- ↑ »Tracking SARS-CoV-2 variants«. www.who.int (v angleščini). Pridobljeno 1. junija 2021.
- ↑ Shahhosseini, Nariman; Babuadze, George (Giorgi); Wong, Gary; Kobinger, Gary P. (Maj 2021). »Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS-CoV-2 Variants of Concern«. Microorganisms (v angleščini). 9 (5): 926. doi:10.3390/microorganisms9050926. PMC 8146828. PMID 33925854.
- ↑ Ihan, Alojz. »Delovanje cepiv proti covid-19« (PDF). NIJZ. Pridobljeno 17. avgusta 2021.
- ↑ 10,0 10,1 Corum, Jonathan; Zimmer, Carl (18. januar 2021). »Inside the B.1.1.7 Coronavirus Variant (Updated Feb. 18, 2021)«. The New York Times. Pridobljeno 23. februarja 2021.
- ↑ »V Sloveniji potrdili južnoafriško različico novega koronavirusa«. Delo. 26. februar 2021. Pridobljeno 18. avgusta 2021.
- ↑ »Sledenje različicam SARS-CoV-2«. NLZOH. 1. julij 2021. Pridobljeno 18. avgusta 2021.